Väčšina trate R100 a R66 vedie po chodníkoch s turistickým značením.
Pre Vlastné značenie R100 a R66 bude použitá biela páska s potlačou R100 R66.

Nočné značenie bude pomocou reflexných terčov a reflexných šípok.
Na trati bude použité aj doplnkové značenie vo forme tabuliek pre informáciu o smere, kontrole, občerstvovacej stanici a i.